При възстановяването на Факултета по ветеринарна медицина към Висшия лесотехнически институт през 1994 г. е създадена първата катедра “Анатомия, хистология и ембриология” с ръководител проф. д-р Георги Ковачев, двмн. През 1999 г. е създадена обединена катедра “Анатомия, хистология и физиология” на базата на катедра “Анатомия, хистология и ембриология” и “Предклинични ветеринарномедицински науки”, на която тогава е бил ръководител проф. Никола Седлоев. За ръководител на новата катедра “Анатомия, хистология и физиология” е избран проф. д-р Йончо Костов, двмн. През периода 2006 – 2012 год. ръководител на катедрата е проф. д-р Георги Георгиев. От 2012 до 2019 год. ръководител катедра е проф. д-р Янислав Илиев, а от 02.03. 20 до 11.05. 2021 год. ръководител на катедрата е доц. д-р Георги Иванов Георгиев

Преподаваните сега дисциплини в Катедрата – “Цитология и хистология”, “Ембриология”, “Анатомия на домашните животни” (систематична и топографска анатомия), “Физиология на животните” са фигурирали и като самостоятелни катедри в структурата на Ветеринарномедицинския факултет при СУ “Св. Кл. Охридски”, София (1923г.). Така са преподавани и във Висшия ветеринарномедицински институт “Проф. д-р Г. Павлов”, София до 1974 г., когато Институтът е пребазиран като Факултет в състава на ВИЗВМ, Стара Загора. От 1995 г. в катедрата се преподава и дисциплината “Етология на животните”. В новият учебен план на катедрата от 2016 год. са включени и се преподават две нови дисциплини – Морфологична практика и Клинична анатомия.

Катедра „Животновъдни науки“ е създадена през 1995 г. като обединяваща основни дисциплини, необходими за изграждането на висококвалифицирани специалисти по ветеринарна медицина, с ръководител проф. дн. Димитър Стоев Добриянов, а след него ръководители на катедрата са били доц. д-р Малчо Господинов Петров, проф. д-р Байко Димитров Байков, доц. д-р Илия Стоянов Ралчев и проф.д-р Запрянка Николаева Шиндарска. От март 2020 до 11.05.2021 ръководител на катедрата е Доц. д-р Андрей Куртенков.

Включените дисциплини в катедрата дават съвременни познания, задължителни за всеки ветеринарен лекар в областта на генетиката и развъждането, биохимия, общата патология и имунология, технологиите и хигиенните изисквания при производството на биологична продукция в животновъдството, основните видове животни, породния състав, съвременните изисквания при храненето на домашните животни, както и влиянието на отделните фуражи и добавки върху здравословното състояние, репродуктивните функции на животните и качеството на получената продукция. Задължителните дисциплините преподавани в катедрата са тринадесет на брой: Професионална етика, Екология, Молекулярна биология, Хранене и агрономия, Генетика и развъждане на животните, Биохимия, Животновъдство, Ветеринарномедицинска хигиена и технология в животновъдството, Имунология, Патология (Патологична физиология), Обществено ветеринарно дело и законодателство, Съдебна ветеринарна медицина. В катедрата се преподават и шест избираеми дисциплини: История на ветеринарната медицина, Кинология, Работа с лабораторни животни, хуманно отношение към тях и организация на експеримента, Качество и безопасност на храните за животни, Ветеринарно обслужване на биологичното животновъдство. Генетични диагностични методи във ветеринарната медицина. Към катедрата е и задължителната лятна учебна практика по Животновъдство след трети курс. Научните изследвания са в областта на оценката на въздействието на различни фактори върху продуктивността на домашните животни, управлението на еволюцията на животните, характеристики на имунния отговор, анализ и усъвършенстване на законодателната база в областта на ветеринарната медицина и животновъдството и др.

През 2021 година е създадена обединена катедра “Анатомия, физиология и животновъдни науки” на базата на катедра “Анатомия, хистология и физиология” и катедра „Животновъдни науки”