Студентите се приемат за обучение в образователно-квалификационна степен “магистър” с конкурс по документи. Системата за балообразуване се публикува ежегодно в Справочник за кандидат-студенти. Обучението е с продължителност 3 семестъра за редовна и 4 семестъра за задочна форма. Получените високи оценки при институционалната и програмната акредитация предоставят възможност за обучение и срещу заплащане. Кандидати от други специалности могат да се обучават за магистри по специалност “Горско стопанство” по индивидуален учебен план и продължителност на обучението съобразно предходната им подготовка.

По време на магистратурата се изучават по-задълбочено и на по-високо ниво управленски, специализиращи и методично-изследователски дисциплини, селекционирани в зависимост от избраната специализация. Задълбочената фундаментална подготовка се осъществява чрез пет задължителни дисциплини – Горска политика, Многофункционално стопанисване на горите, Управление на горското стопанство и човешките ресурси, Географски информационни системи.

Профилирането по специалността се постига в три специализации:

• Стопанисване на горите;
• Ловно и рибно стопанство;
• Лесоползване и икономика на горското стопанство.

Съобразно специализацията, студентите избират и изучават шест избираеми и една факултативна дисциплина и провеждат една учебна практика. Придобиват се навици и умения за проектиране, планиране и осъществяване на дейностите, свързани с ръководството на горското стопанство, овладяват се основите на научните изследвания по проблемите на горите. Магистратурата завършва с разработване и защита на дипломна работа. За изучените общо 12 дисциплини с практиката и дипломната работа трябва да се натрупат не по-малко от 90 кредита по ECTS. Успешно завършилите получават диплома за образователно-квалификационна степен “магистър” и придобиват професионална квалификация “Магистър-инженер по горско стопанство”. Този ценз им дава право да заемат ръководни длъжности в системата на горите, МОСВ, да извършват научна и преподавателска дейност във висшите училища, да работят в научно-изследователски институти, опитни, семеконтролни, лесозащитни и други станции. Придобилите степен “магистър” имат право да се обучават за получаване на образователна и научна степен “доктор”.